Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
VdrP48281 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
VdrP48281 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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