Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RxraP28700 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RxraP28700 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms