Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms