Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PdgfaP20033 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PdgfaP20033 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PdgfaP20033 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PdgfaP20033 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PdgfaP20033 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PdgfaP20033 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PdgfaP20033 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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