Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
P10404 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms