Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
H2-Eb1P04230 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
H2-Eb1P04230 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 306.2 ms