Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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Ccl20O89093 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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