Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm11236J3QMS7 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms