Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms