Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms