Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms