Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rb1cc1Q9ESK9 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rb1cc1Q9ESK9 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms