Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 C330007P06Rik-201ENSMUST00000047486 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Gm10824-201ENSMUST00000220000 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Rtel1-204ENSMUST00000108814 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Gm44503-201ENSMUST00000149692 4383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Senp3Q9EP97 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Senp3Q9EP97 Tpd52l2-201ENSMUST00000000844 2950 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Senp3Q9EP97 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Senp3Q9EP97 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Cox7a1-201ENSMUST00000098594 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Senp3Q9EP97 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Senp3Q9EP97 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Senp3Q9EP97 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Fancb-203ENSMUST00000167446 2953 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Zfp949-203ENSMUST00000161458 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Aasdh-202ENSMUST00000120963 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Phf21a-208ENSMUST00000111294 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 D930048N14Rik-201ENSMUST00000064493 3426 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Dhx35-201ENSMUST00000029186 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Senp3Q9EP97 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Gm29427-201ENSMUST00000188520 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Slc25a14-202ENSMUST00000114936 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 H6pd-202ENSMUST00000084117 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Senp3Q9EP97 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Senp3Q9EP97 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Senp3Q9EP97 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Senp3Q9EP97 Mtmr6-201ENSMUST00000022563 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Ncald-201ENSMUST00000090150 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Acox3-201ENSMUST00000068563 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Pde4b-202ENSMUST00000097949 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Zfp454-206ENSMUST00000163301 2090 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Apex2-206ENSMUST00000112727 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Tnni2-201ENSMUST00000105971 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Senp3Q9EP97 Gm13904-201ENSMUST00000121901 837 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms