Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Snx8Q8CFD4 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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