Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms