Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

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Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Smarca2Q6DIC0 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Smarca2Q6DIC0 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Smarca2Q6DIC0 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Smarca2Q6DIC0 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Smarca2Q6DIC0 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smarca2Q6DIC0 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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