Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sft2d1Q5SSN7 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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