Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Trafd1Q3UDK1 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms