Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rpusd2Q149F1 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rpusd2Q149F1 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
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