Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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VdrP48281 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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VdrP48281 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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