Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp4P35123 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms