Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxc11P31313 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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