Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
RxraP28700 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
RxraP28700 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
RxraP28700 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
RxraP28700 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RxraP28700 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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RxraP28700 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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