Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms