Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms