Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms