Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Ccl20O89093 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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