Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hdac5Q9Z2V6 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Hdac5Q9Z2V6 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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Hdac5Q9Z2V6 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Hdac5Q9Z2V6 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Hdac5Q9Z2V6 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Hdac5Q9Z2V6 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Hdac5Q9Z2V6 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Hdac5Q9Z2V6 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Hdac5Q9Z2V6 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Hdac5Q9Z2V6 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms