Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
OtofQ9ESF1 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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