Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Smg9Q9DB90 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Smg9Q9DB90 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms