Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Ccdc47Q9D024 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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