Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Trim12aQ99PQ1 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Trim12aQ99PQ1 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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Trim12aQ99PQ1 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Trim12aQ99PQ1 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Trim12aQ99PQ1 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Trim12aQ99PQ1 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Trim12aQ99PQ1 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Trim12aQ99PQ1 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Trim12aQ99PQ1 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Trim12aQ99PQ1 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Trim12aQ99PQ1 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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