Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NischQ80TM9 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NischQ80TM9 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms