Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Actn1Q7TPR4 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms