Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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