Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp49Q6P9L4 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp49Q6P9L4 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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