Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms