Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Gm28047Q3US59 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Gm28047Q3US59 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Gm28047Q3US59 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Gm28047Q3US59 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Gm28047Q3US59 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Gm28047Q3US59 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Gm28047Q3US59 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Gm28047Q3US59 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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