Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12394-201ENSMUST00000107981 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnd2-201ENSMUST00000000188 6330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Acsl6-206ENSMUST00000101211 3106 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Fn3k-203ENSMUST00000103014 3841 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Sulf2-207ENSMUST00000146497 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Klhl28-201ENSMUST00000021331 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15169-202ENSMUST00000130794 2335 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gtpbp6Q3U6U5 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gtpbp6Q3U6U5 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gtpbp6Q3U6U5 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms