Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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