Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Pkp1P97350 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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