Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms