Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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