Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
VdrP48281 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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