Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Rpl28P41105 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms