Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp4P35123 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp4P35123 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp4P35123 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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