Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms