Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ggta1P23336 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms