Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccl20O89093 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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