Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc180J3QNE4 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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